Det ska inte vara några problem att anlända till annat land.
Men i Indonesien ansöker man sedan några månader inte längre på ambassaden, utan genom en agent:
Sweden Visa Information - Indonesia - Home Page
Och på deras FAQ står det:
I am visiting more than one Schengen-country. Where do I have to apply for my Schengen-visa?
If you intend to visit several Schengen countries you have to apply for the visa of the country of your main destination. Main reason can be a business trip, a funeral, etc. It does not need to be the longest trip. The main destination is determined by the length and purpose of your stay.
I will be spending an equal amount of time in two or more Schengen-countries. Where do I have to apply for the visa?
If no main destination of your trip can be determined (equal length and purpose of stay), the country where you will first enter into the Schengen region will have to issue your visa.
Och jag skulle kunna tänka mig att det är därför din kollega får det svar hon får.
Har precis gjort en ansökan via VFS och de svar man får från dom är i nivå med en del av de kundtjänster som diskuteras här på BC. Dom kräver dokument som enligt ambassaden inte behövs osv..
Vid behov kan jag pm:a ett bra namn (mail adress) på ambassaden.